sunnuntai 26. toukokuuta 2019

Piirsikö evoluutio korvan rakennuspiirustukset DNA:han?


Edellisessä artikkelissa on video siitä, miten korva toimiessaan muuntaa informaatiota muodosta toiseen. Katsotaanpa tarkempaa korvassa olevaa vasara-alasin rakennetta ja mitä informaatiota on se tarvinnut muodostuakseen.

Vasara-alasinrakenne koostuu useista osista, jotka ovat luuta. Luu taas koostuu soluista ja solujen tuottamasta väliaineesta.1 Vaikka korvan sisällä olevat kuuloluut ovat hyvin pieniä, rakentuvat nekin tuhansista ja taas tuhansista soluista. Miten nämä solut osaavat rakentaa juuri kuuloluun toiminnallisuuden ja muodon?

Kuuloluiden osat

Sisäkorva - kuloluut keskellä


Jokaisessa saman eliön solussa on periaatteessa sama DNA. DNA:ssa on rakennusohjeet, mutta siellä ei ole kuuloluiden rakennusohjetta!

Tämä on hämmästyttävää! Ei siellä silti ole silmien, nenän, hampaiden, sydämen, sisäelimien ihon tai minkään muunkaan kudoksen rakennusohjetta. Miten solut sitten voivat muodostaa elimiä?

Elimien rakennusohjeiden sijasta DNA:ssa on ohjeita, miten rakennetaan proteiineja, monimutkaisia molekyylejä, pieniä koneita, joiden avulla ihmisen solut toimivat. Nämä proteiinit ja entsyymit eivät kuitenkaan ole kuuloluita tai muitakaan näkyviä rakenteitamme.


Proteiinit ovat pieniä nanorobotteja, jotka toimivat solukalvon sisällä
ja toisinaan solujen välisessä tilassa.

Alkiokehityksen alkuvaiheessa kaikki solut toimivat samalla tavalla, kutakuinkin. Kaikki alkaa yhdestä hedelmöittyneestä munasolusta ja tästä eteenpäin solut lisääntyvät jakautumalla. Joidenkin kymmenien jakaantumiskertojen jälkeen solut alkavat erikoistua. Muutamien viikkojen jakautumisien jälkeen jotkin solut alkavat erikoistumaan kuuloluusoluiksi.

Koko tämä prosessi on kiivaan tutkimisen kohteena, mutta vielä ei pystytä varmaksi sanomaan, mikä laukaisee solun erikoistumisen. Joka tapauksessa epigeneettisellä ohjauksella solu lopulta erikoistuu. Sen ansiosta solussa ikään kuin kytkin asettuu siihen asentoon, että siitä tulee kuuloluusolu. (Katso lisää epigenetiikasta ja DNA:sta viitteissä olevista linkeistä 3 ja 4, joissa olen niitä avannut yksinkertaisella tavalla.)


Solujen Internet ja keskinäinen viestintä 'solujen somessa'

DNA:ssa on paljon laskureita, joiden täytyy tietää mm. kuinka monta kertaa solu on jakautunut. Mutta kun kaikissa soluissa on samat laskurit, jonkin toisen tekijän on kerrottava minkälaiseksi solun pitää erikoistua. Tämä vaatii paljon informaation välitystä, siis kommunikointia, solujen kesken. Solut keskustelevat, että koska minusta tulee tärykalvosolujen esi-isä, sinusta pitää tulla kuuloluusolujen esi-isä. Tarkkaan ei tiedetä millaista 'kättelyä' tässä tapahtuu, jotta solut pääsevät yhteisymmärrykseen siitä, etteivät kaikki toteuta samaa rakennetta.

Keskustelu tapahtuu DNA:sta tehtävien microRNA 'pätkien' avulla

Eri tapoja, miten 'solujen internet' kuljettaa viestejä2 - Mitä tapahtuisi, jos näitä kuljettajia ei olisi? Mitä tapahtuisi Internetille, jos ei olisi fyysistä verkkoa? Tieto ei kulkisi eli monisoluinen elilö ei voisi olla olemassa.  

Tietojenkäsittelytieteestä tiedämme, että on erilaisia protokollia kättelyiden toteuttamiseen ja siihen, miten tällaiset itsenäiset tahot voivat päästä yhteisymmärrykseen siitä, kuka erikoistuu mihinkin. (Tyypillisesti esimerkiksi suurissa palvelinohjelmoistoissa, jotka muodostuvat itsenäisistä palvelimista ja jakautuvat monelle fyysiselle palvelimelle, yhdestä palvelinohjelmasta tulee master-palvelin ja muista 'orjia'. Ohjelmat sopivat tämän keskenään sen mukaan, missä tahdissa ne käynnistyvät. Tätä sopimista tehtäessä tarvitaan kättelyprotokollaa, jotta saavutetaan konsensus siitä, kuka ottaa minkäkin roolin. Tämä kaikki on ohjelmoitu merkki-merkiltä ohjelmiston koodiin.)

Tällainen keskustelu pitää tapahtua protokollalla, jota keskustelun kaikki osapuolet ymmärtävät. Se ei voi olla satunnaista signaalien välitystä, vaan tarkoin suunniteltua ja järjestäytynyttä. Sen lisäksi jokaisen solun on uskollisesti pitäydyttävä tehdyssä sopimuksessa ja muutettava sitä vain tarvittaessa kaikkien lähisolujen kanssa yhteisessä ymmärryksessä (esimerkiksi virhetilanteissa).

Tämän jälkeen kuuloluusolujen, jotka tulevat siis jakautumalla kuuloluu esi-isä solusta, pitää vielä muodostaa tarkoin suunniteltu vasara-alasin-rakenne, jotta kuulosignaali voidaan välittää tärykalvolta simpukkaan. Tätä rakennetta toteutettaessa jokaisen tuhansista luusoluista pitää ottaa täsmälleen oikeanlainen kolmiulotteinen muoto, jotta kokonaisuudella on oikea kolmiulotteinen muoto. Jälleen tarvitaan paljon kommunikointia solujen välillä.


Informaation, tiedon ja kommunikoinin, merkitys solujen erikoistumisessa on ratkaisevaa

DNA:n rakennusohjeissa on siis vain proteiinien ja entsyymien rakennusohjeita, siellä ei ole suoraan tämän kuuloluun rakennusohjetta. On hämmästyttävää, että siitä huolimatta rakenne syntyy oikein! Proteiinit hoitavat yksittäisen solun rakenteen sellaiseksi kolmiulotteiseksi palaseksi, kuin juuri siihen paikkaan kuuluu. Niiden on siis oltava tietoisia sijainnistaan kuuloluussa. Valtavalla määrällä kommunikointia vieressä olevien solujen kanssa ja DNA:n ohjelmoitujen laskurien ja ohjeiden avulla, jokainen solu saa sen rakenteen, että lopputulos vastaa toimivaa kuuloluuta.

Kiinnitä huomiota kahteen asiaan: 1) rakennusohjeet ovat epäsuoria 2) informaation välitystä on niin solun sisällä kuin solujen välilläkin kokoajan kuin Internetissä ikään. 


Evoluutioväittämä

Luonnonvalinta kohdistuu aina ulkoasuun (fenotyyppi). Useimmilla eläimillä kuurous on haitallista ja vaikuttaa lisääntymismahdollisuuksiin negatiivisesti. Näin kuurous (esim. väärin muodostuneet kuuloluut) karsiutuvat lisääntymisketjusta ja täten eläinpopulaation perimästä (DNA:sta).

Mutta evoluutio-opin mukaan kaikki ovat aikojen alussa olleet kuuroja ja kuuloaistimus on kehittynyt vähitellen. Tämän luonnonvalinnan, joka karsii pois huonot kuuloluut, pitäisi siis myös jotenkin pystyä jalostamaan DNA:han sellaisia rakennusohjeita, jotka rakentavat sellaisia proteiineja, joista lopulta muodostuu toimiva kuuloluu oikeaan paikkaan ja oikeaan aikaan sikiönkehitystä.

Luonnonvalinta ei siis voi mitenkään suosia tiettyä geenijaksoa DNA:ssa, josta tulee jokin proteiini, vaan se voi suosia vain jotain jo valmista rakennetta tai toiminnallisuutta, josta on jotenkin hyötyä lisääntymiselle (ja mukana tulee siis koko perimä). Nämä kuuloluun rakenteet tulevat DNA:sta hyvin epäsuorasti ja lisäksi vaativat paljon epigeneettistä ohjausta ja informaatiovirtaa muiden solujen välillä. Juuri tämä solujen yhteistoiminta lisää järjestelmän monimutkaisuutta lukemattomia kertaluokkia. Satunnainen rakenteiden synnyttäminen tulee enemmän kuin epätodennäköiseksi.

Valinta siis kohdistuu aivan muuhun kuin yksittäiseen proteiinin rakennusohjeeseen DNA:ssa, mutta kuitenkin evoluutio-oppi väittää, että yksittäiset pienet satunnaiset muutokset DNA:n rakennusohjeissa luovat uutta. Tässä on evoluutio-opin yksi monista ratkaisemattomista kysymyksistä: Miten ulkoasun valinta voi kehittää uusia proteiinien rakennusohjeita?

Uskoni ei riitä ymmärtämään tätä ja edellä kuvaamani logiikka sen yksiselitteisesti tekee mahdottomaksi: evoluutiolta uupuu mekanismi kehittää rakenteita, koska se ei voi koodata DNA:ta tietäen, mitä siitä monen muun vaikuttavan tekijän toimesta voisi tulla. Tunnetusti satunnaisuus vain hajottaa. Evoluutioajatus toimii vain kaukaa kuvitellen, ei enää yksityiskohtia katsottaessa.

Jotkin lähteet, kuten Wikipedia, mainitsee, että kuuloluiden kehittyminen liskojen leukaluusta on hyvin dokumentoitu. Se dokumentaatio on pelkän mielikuvituksen tuotetta. Kuvittele niitä miljoonia oikeansuuntaisia muutoksia, mitä DNA:ssa tarvitaan, jotta leukaluusta tulisi tarkoin määritelty kolmiulotteinen vasara ja alasin oikeaan paikkaan ja yhtä aikaa tärykalvon, simpukan, kuulohermojen ja aistimusta ymmärtävien aivojen kanssa; vasta ymmärtäminen tekee kuuloluusta hyödyllisen ja vasta silloin voi luonnonvalinta sen 'hyväksyä' osaksi populaation perimää.

Jokaisen mini-vaiheen, uuden toimivan proteiinivariantin, joka vain epäsuorasti vaikuttaa rakenteeseen, pitäisi olla hyödyllinen, jotta se ei geneettisen ajautumisen kautta poistuisi populaatiosta muutamassa sukupolvessa. Ja kun vielä tähtitieteellisen harva satunnaisesti tehty proteiini on jotain muuta kuin toimimaton mytty, niin eikö voida aivan reilusti sanoa, että edes miljardit vuodet eivät riitä, jotta kuuloluu voisi tulla satunnaisen prosessin lopputuloksena? Mikään kuviteltavissa oleva aika ei ole tarpeeksi toimimattomien kokeilujen karsimiseen. Sen sijaan tarvitaan kaiken Suunnittelija, Luoja, joka kerralla laittaa kaiken kuntoon.


Viitteen:
  1. Hyvä suomenkielinen sivusto soluista ja tässä erityisesti luusolusta: http://www.solunetti.fi/fi/histologia/luusolut_1/
  2. Lisää miRNA viestinnästä kts esimerkiksi tämä tutkimus: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5709614/
  3. DNA:sta: https://mistametulemme.blogspot.com/2019/01/pieni-johdatus-genetiikkaan-ymmarra.html
  4. Lisää epigenetiikasta:

Ei kommentteja:

Lähetä kommentti